لنعرف هذه العلاقة يجب أن نعرف أولاً آلية حدوث الشقيقة. حاولت عدة نظريات تفسير آلية حدوث الشقيقة، واتفق معظمها على أنه يحدث تقلص شديد في الأوعية الدماغية يتبعه توسع شديد وألم، وهذا التقلص قد يحدث بواسطة عدة عوامل كيميائية ونفسية وعوامل أخرى. إن أهم عامل كيميائي في هذه النظرية هو مادة السيروتونين التي تفرز في الدماغ حيث أن زيادة إفرازها تؤدي إلى تقلص في الأوعية الدماغية.